Lavar bien la fruta. Descorazonar las manzanas y retirar la parte dura del tomate con una puntilla. Pelar las chalotas.
Cortar a trozos grandes las chalotas, los tomates y las manzanas.
En una olla grande, calentar el agave y el vinagre a fuego lento e ir removiendo durante 2 minutos.
Extraer el zumo de limón con un exprimidor de cítricos. Agregar las chalotas, los tomates, las manzanas y el zumo de limón a la olla. Añadir también el resto de ingredientes. Remover y llevar la mezcla al punto de ebullición. Bajar el fuego al mínimo y dejar que se cuece gradualmente durante 2 horas y ½. Ir removiendo de vez en cuando.
Mientras tanto, esterilizar los frascos, hirviéndolos durante 10 minutos. Para esta receta, se necesitan 4 tarros de 500 ml o equivalentes. Al pasar el tiempo, dibujar una línea en la base de la olla con una cuchara de madera y, si la línea no desaparece, el chutney está suficientemente espeso. Apagar el fuego.
Con cuidado, verter el chutney caliente en los frascos esterilizados y taparlos bien con el uso de guantes de horno. Dejar que el frasco se enfríe antes de etiquetarlo. Almacenarlo en un lugar seco, fresquito y oscuro. Dejar que madure de 6 a 8 semanas antes de disfrutar.
Una vez abierto, conservar en la nevera.